Coprinopsis cinerea
Mitä sinun pitäisi tietää
Coprinopsis cinerea on syötävä sieni, mutta se on käytettävä viipymättä keräämisen jälkeen.
Se on erinomainen malliorganismi sienien monisoluisen kehityksen tutkimiseen, koska sitä on helppo kasvattaa laboratoriossa ja se suorittaa koko elinkaarensa kahdessa viikossa.
Pileus (lakki) muuttaa kokoaan kasvaessaan ja kypsyessään 2 cm x 1 cm:n kokoiseksi.5 cm suljettu, 3 cm:iin.0cm auki, ja se muuttaa muotoaan ellipsoidista, laajenee kuperaksi ja lopulta tasokoveraksi. Sen keskellä se on harmaanruskea, vaaleampi lähellä reunaa, jossa on valkoinen/hopeanvärinen huntu. C. cinerea kasvaa erityisen hyvin lannassa ja mädäntyneessä kasvillisuudessa, ja sitä tavataan yleisesti kaikkialla maailmassa.
C. cinerea-kanta Okayama 7 julkaistiin vuonna 2010. Genomi on kooltaan 36Mb 13 kromosomissa, ja siinä on noin 13 000 ennustettua proteiineja koodaavaa geeniä.
Muu nimi: Gray Shag.
Coprinopsis cinerea Genomi
Tämän genomin on sekvensoinut Broad-instituutti.
Coprinus cinereus -sekvenssihanke on osa Broad Institute's Fungal Genome Initiative -hanketta. Sen tavoitteena on julkaista kymmenkertainen genomisekvenssin kattavuus Coprinus cinereus -kannalle Okayama 7 (#130). Coprinuksen genomihanke on Broad-instituutin ja Coprinus-tutkimusyhteisön välinen kumppanuus.
Genomista DNA:ta genomiprojektia varten toimitti Patricia Pukkila Pohjois-Carolinan yliopistosta. Broad tuotti koko genomin shotgun-sekvenssin 4kb:stä & 10kb:n plasmidit ja 40kb:n fosmidit. Tuloksena syntynyt 10X-kokoonpano julkistettiin heinäkuussa 2003. Tämä Whole Genome Shotgun -projekti on talletettu DDBJ/EMBL/GenBankiin projektitunnuksella AACS00000000. Automaattisen genomin annotoinnin tulokset julkistetaan syksyllä 2003.
Coprinus cinereus on monisoluinen basidiomykeetti, jolla on tyypillinen sienimuoto ja joka käy läpi täydellisen sukupuolisyklin. Toisin kuin useimmat sienet, C. cinereus voi suorittaa koko elinkaarensa (2 viikkoa) laboratoriossa. Sen helppo kasvatus yksinkertaisilla määritellyillä väliaineilla mahdollistaa laajan geneettisen ja molekyylianalyysin. Kunkin parittelutyypin itiöt tuottavat monokaryoottisen myseelin. Yhteensopivien hyfojen fuusio muodostaa dikaryoottisen sienirihmaston, joka muodostaa hedelmöityskappaleen - miniatyyrisienen, jossa on kolme erillistä kudosta (kidukset, varsi ja lakki).
Primordium kasvaa, ja kidusten hymeniaalikerrosten basidiaalisolut aloittavat ja saattavat päätökseen ydinfuusion, meioosin ja haploidien basidiosporeiden muodostumisen. itiöiden kypsymiseen ja aktiiviseen purkautumiseen korkista liittyy varren piteneminen ja jäljelle jäävän kiduskudoksen itsesulaminen.
Lähteet:
Kuva 1 - Tekijä: Aasi laukaus (CC BY-SA 4.0 Kansainvälinen)
Kuva 2 - Tekijä: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Generic)
Kuva 3 - Tekijä: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Geneerinen)
Kuva 4 - Tekijä: Tekijä: Aasi laukaus (CC BY-SA 4.0 International)
