Coprinopsis cinerea
Wat je moet weten
Coprinopsis cinerea is een eetbare paddenstoel, maar moet onmiddellijk na het verzamelen gebruikt worden.
Deze paddenstoel heeft donkere sporen en is een uitstekend modelorganisme voor de studie van meercellige ontwikkeling bij schimmels, omdat hij gemakkelijk in het laboratorium gekweekt kan worden en zijn hele levenscyclus in 2 weken voltooit.
De pileus (hoed) verandert van grootte naarmate hij groeit en rijpt van 2 cm x 1 cm.5cm gesloten, tot 3.0cm open, en het verandert van vorm van ellipsoïde, uitdijend naar convex en uiteindelijk planoconcaaf. In het midden is hij grijsbruin, aan de rand lichter met een witte/zilveren sluier. C. cinerea groeit bijzonder goed op mest en rotte vegetatie en komt overal ter wereld voor.
Het genoom van C. cinerea stam okayama 7 werd gepubliceerd in 2010. Het genoom is 36Mb groot op 13 chromosomen, met ongeveer 13.000 voorspelde eiwit-coderende genen.
Andere naam: Grijze klauwier.
Coprinopsis cinerea genoom
Dit genoom is gesequenced door het Broad Institute.
Het Coprinus cinereus-sequentieproject maakt deel uit van het Fungal Genome Initiative van het Broad Institute. Het doel is om een 10X genoomsequentiedekking vrij te geven voor Coprinus cinereus, stam Okayama 7 (#130). Het Coprinus genoom project is een samenwerkingsverband tussen het Broad Institute en de Coprinus onderzoeksgemeenschap.
Genomisch DNA voor het genoomproject werd geleverd door Patricia Pukkila van de Universiteit van North Carolina. Broad produceerde een hele genoom shotgun sequentie van 4kb & 10kb plasmiden en 40kb fosmiden. De resulterende 10X assemblage werd openbaar gemaakt in juli 2003. Dit Whole Genome Shotgun project is gedeponeerd bij DDBJ/EMBL/GenBank onder de projecttoegang AACS00000000. De resultaten van de geautomatiseerde genoomannotatie zullen in het najaar van 2003 openbaar worden gemaakt.
Coprinus cinereus is een meercellige basidiomycet met een typische paddenstoelvorm die een volledige seksuele cyclus ondergaat. In tegenstelling tot de meeste paddenstoelen gaat C. cinereus kan zijn hele levenscyclus (2 weken) in het laboratorium voltooien. De gemakkelijke kweek op eenvoudige gedefinieerde media maakt uitgebreide genetische en moleculaire analyse mogelijk. Sporen van elk paringstype produceren een monokaryotisch mycelium. De fusie van compatibele hyfen vormt een dikaryotisch mycelium dat een vruchtlichaam vormt - een miniatuurpaddenstoel met drie verschillende weefsels (kieuw, steel en hoed).
Het primordium groeit en de basidiale cellen van de hymeniale lagen in de lamellen initiëren en voltooien kernfusie, meiose en haploïde vorming van basidiosporen. Rijping van de sporen en actieve afscheiding uit de hoed gaan gepaard met strekking van de steel en autodigestie van het resterende kieuwweefsel.
Bronnen:
Foto 1 - Auteur: Ezelshot (CC BY-SA 4.0 Internationaal)
Foto 2 - Auteur: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Algemeen)
Foto 3 - Auteur: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Algemeen)
Foto 4 - Auteur: Ezel opname (CC BY-SA 4.0 Internationaal)
