Coprinopsis cinerea

Vad du bör känna till

Coprinopsis cinerea är en ätlig svamp, men måste användas omedelbart efter insamling.

Denna svamp har mörka sporer och är en utmärkt modellorganism för studier av multicellulär utveckling hos svampar eftersom den är lätt att odla i laboratoriet och den fullbordar hela sin livscykel på 2 veckor.

Pileus (hatten) ändrar storlek när den växer och mognar från 2 cm x 1.5 cm stängd, till 3.0 cm öppen, och den ändrar form från ellipsoid, expanderande till konvex och slutligen plano-konkav. I mitten är den gråbrun, blekare nära kanten med en vit/silvrig slöja. C. cinerea växer särskilt bra på dynga och ruttnande vegetation och är vanligt förekommande över hela världen.

Genomet för C. cinerea stam okayama 7 publicerades 2010. Genomet är 36 Mb stort på 13 kromosomer, med cirka 13 000 förutsagda proteinkodande gener.

Annat namn: Grå skäggdopping.

Coprinopsis cinerea Genom

Detta genom sekvenserades av Broad Institute.

Coprinus cinereus-sekvensprojektet är en del av Broad Institute's Fungal Genome Initiative. Dess mål är att släppa en 10X genomsekvens täckning för Coprinus cinereus, stam Okayama 7 (#130). Coprinus-genomprojektet är ett partnerskap mellan Broad Institute och Coprinus-forskarsamhället.

Genomiskt DNA för genomprojektet tillhandahölls av Patricia Pukkila vid University of North Carolina. Broad producerade shotgun-sekvenser av hela genomet från 4kb & 10kb plasmider och 40kb fosmider. Den resulterande 10X-monteringen offentliggjordes i juli 2003. Detta Whole Genome Shotgun-projekt har deponerats på DDBJ/EMBL/GenBank under projektanslutningen AACS00000000. Resultaten av den automatiska genomannoteringen kommer att offentliggöras under hösten 2003.

Coprinus cinereus är en flercellig basidiomycet med en typisk svampform som genomgår en fullständig sexuell cykel. Till skillnad från de flesta svampar är C. cinereus kan fullborda hela sin livscykel (2 veckor) i laboratoriet. Dess enkla odling på enkla definierade medier möjliggör omfattande genetiska och molekylära analyser. Sporer av varje parningstyp producerar ett monokaryotiskt mycel. Fusionen av kompatibla hyfer bildar ett dikaryot mycel som bildar en fruktkropp - en miniatyrsvamp med tre distinkta vävnader (gäl, stjälk och hatt).

Primordiet växer och basidialcellerna i hymenialskikten i gälarna initierar och slutför kärnfusion, meios och bildning av haploida basidiosporer. Spormognad och aktiv utsöndring från hättan åtföljs av förlängning av stjälken och autodigestion av den återstående gälvävnaden.

Källor:

Foto 1 - Författare: Bild på åsna (CC BY-SA 4.0 Internationell)

Foto 2 - Författaren: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Generisk)

Foto 3 - Författaren: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Generiska)

Foto 4 - Författare: Bild på åsna (CC BY-SA 4.0 International)