Coprinopsis cinerea
Hvad du bør vide
Coprinopsis cinerea er en spiselig svamp, men skal bruges straks efter indsamling.
Denne svamp har mørke sporer, og den er en fremragende modelorganisme til undersøgelse af flercellet udvikling i svampe, da den er nem at dyrke i laboratoriet, og den gennemfører hele sin livscyklus på 2 uger.
Pileus (hatten) ændrer størrelse, når den vokser og modnes fra 2 cm x 1 cm.5 cm lukket, til 3.0 cm åben, og den ændrer form fra ellipsoid, ekspanderende til konveks og til sidst plano-konkav. I midten er den gråbrun, lysere nær kanten med et hvidt/sølvfarvet slør. C. cinerea vokser især godt på gødning og rådden vegetation og er almindeligt forekommende over hele verden.
Genomet af C. cinerea stamme okayama 7 blev offentliggjort i 2010. Genomet er 36 Mb stort på 13 kromosomer, med ca. 13.000 forudsagte proteinkodende gener.
Andet navn: Grå skælhat.
Coprinopsis cinerea genom
Dette genom blev sekventeret af Broad Institute.
Coprinus cinereus-sekvensprojektet er en del af Broad Institute's Fungal Genome Initiative. Dets mål er at frigive en 10X genomsekvensdækning for Coprinus cinereus, stamme Okayama 7 (#130). Coprinus-genomprojektet er et partnerskab mellem Broad Institute og Coprinus-forskningssamfundet.
Genomisk DNA til genom-projektet blev leveret af Patricia Pukkila ved University of North Carolina. Broad producerede en shotgun-sekvens af hele genomet fra 4kb & 10kb plasmider og 40kb fosmider. Den resulterende 10X-samling blev offentliggjort i juli 2003. Dette Whole Genome Shotgun-projekt er blevet deponeret hos DDBJ/EMBL/GenBank under projekttilgangen AACS00000000. Resultaterne af den automatiserede genomannotation vil blive offentliggjort i efteråret 2003.
Coprinus cinereus er en flercellet basidiomycet med en typisk svampeform, der gennemgår en komplet seksuel cyklus. I modsætning til de fleste svampe er C. cinereus kan gennemføre hele sin livscyklus (2 uger) i laboratoriet. Den er nem at dyrke på simple definerede medier, hvilket muliggør omfattende genetiske og molekylære analyser. Sporer af hver parringstype producerer et monokaryot mycelium. Fusionen af kompatible hyfer etablerer et dikaryotisk mycelium, der danner et frugtlegeme - en miniaturechampignon med tre forskellige væv (gælle, stilk og hat).
Primordiet vokser, og de basidiale celler i de hymeniale lag i gællerne påbegynder og fuldfører kernefusion, meiose og dannelse af haploide basidiosporer. Sporemodning og aktiv udskillelse fra hætten ledsages af forlængelse af stilken og selvfordøjelse af det resterende gællevæv.
Kilder:
Foto 1 - Forfatter: Æsel skudt (CC BY-SA 4.0 International)
Foto 2 - Forfatter: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Generisk)
Foto 3 - Forfatter: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Generisk)
Foto 4 - Forfatter: Æsel skudt (CC BY-SA 4.0 International)
