Coprinopsis cinerea
Čo by ste mali vedieť
Coprinopsis cinerea je jedlá huba, ale musí sa použiť okamžite po zbere.
Táto huba má tmavé výtrusy a je vynikajúcim modelovým organizmom na štúdium mnohobunkového vývoja húb, pretože sa dá ľahko vypestovať v laboratóriu a celý svoj životný cyklus dokončí za 2 týždne.
Pileus (klobúčik) mení veľkosť počas rastu a dozrieva z 2 cm x 1.5 cm zatvorený, až po 3.0 cm otvorená a mení tvar z elipsoidného, rozširuje sa na konvexný a nakoniec na plankonkávny. V strede je sivohnedá, pri okraji bledšia s bielo-strieborným závojom. C. cinerea rastie najmä na hnoji a zhnitej vegetácii a bežne sa vyskytuje po celom svete.
Genóm C. cinerea kmeň okayama 7 bol uverejnený v roku 2010. Genóm má veľkosť 36 MB na 13 chromozómoch a obsahuje približne 13 000 predpokladaných génov kódujúcich proteíny.
Iný názov: Cinrinus Coprinus: Šedý chvostoskok.
Genóm Coprinopsis cinerea
Tento genóm bol sekvenovaný Broad Institute.
Projekt sekvencie Coprinus cinereus je súčasťou iniciatívy Broad Institute's Fungal Genome Initiative. Jej cieľom je zverejniť 10-násobné pokrytie sekvencie genómu Coprinus cinerea, kmeň Okayama 7 (č. 130). Projekt genómu Coprinus je partnerstvom medzi Broad Institute a výskumnou komunitou Coprinus.
Genomickú DNA pre projekt genómu poskytla Patricia Pukkila z University of North Carolina. Široká produkcia celogenomovej shotgun sekvencie zo 4kb & 10kb plazmidy a 40kb fosmidy. Výsledná zostava 10X bola zverejnená v júli 2003. Tento projekt Whole Genome Shotgun bol uložený v DDBJ/EMBL/GenBank pod projektovým číslom AACS00000000. Výsledky automatizovanej anotácie genómu budú zverejnené na jeseň 2003.
Coprinus cinereus je viacbunkový bazídiomycét s typickou formou huby, ktorá prechádza kompletným pohlavným cyklom. Na rozdiel od väčšiny húb, C. cinereus môže v laboratóriu dokončiť celý svoj životný cyklus (2 týždne). Jej jednoduchá kultivácia na jednoduchých definovaných médiách umožňuje rozsiahle genetické a molekulárne analýzy. Výtrusy každého typu párenia vytvárajú monokaryotické mycélium. Spojením kompatibilných hýf vzniká dikaryotické mycélium, ktoré vytvára plodnicu - miniatúrnu hubu s tromi odlišnými tkanivami (žiabra, stopka a klobúk).
Primordium rastie a bazálne bunky hyméniových vrstiev v žiabre iniciujú a dokončujú jadrovú fúziu, meiózu a tvorbu haploidných bazídií. Dozrievanie spór a aktívne vypúšťanie z klobúčika je sprevádzané predlžovaním stopky a autodigesciou zvyšného žiabrového tkaniva.
Zdroje:
Fotografia 1 - Autor: Oslí záber (CC BY-SA 4.0 International)
Fotografia 2 - Autor: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Všeobecný)
Foto 3 - Autor: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Generic)
Fotografia 4 - Autor: Oslí výstrel (CC BY-SA 4.0 International)
