Coprinopsis cinerea
Mida peaksite teadma
Coprinopsis cinerea on söödav seen, kuid seda tuleb pärast kogumist kiiresti ära kasutada.
Sellel seenel on tumedad eosed ja ta on suurepärane mudelorganism seente paljuraksete arengu uurimiseks, kuna teda on lihtne laboris kasvatada ja ta lõpetab kogu oma elutsükli 2 nädalaga.
Pileus (müts) muutub kasvades ja küpsedes 2 cm x 1 cm suuruseks.5 cm suletud, kuni 3.0 cm avatud ja muudab oma kuju ellipsoidist, laieneb kumeraks ja lõpuks muutub tasapinnaliseks. Keskosas on ta hallikaspruun, serva lähedal heledam, valge/hõbedase looriga. C. cinerea kasvab eriti hästi sõnnikul ja mädanenud taimestikul ning teda leidub laialdaselt kogu maailmas.
Genoom C. cinerea tüvi okayama 7 avaldati 2010. aastal. Genoomi suurus on 36Mb 13 kromosoomil, milles on ligikaudu 13 000 prognoositud valku kodeerivat geeni.
Muu nimetus: Gray Shag.
Coprinopsis cinerea genoom
Selle genoomi sekveneeris Broad Institute.
Coprinus cinereus'e järjestuse projekt on osa Broad Institute'i seenegeneomi algatusest (Fungal Genome Initiative). Selle eesmärk on avalikustada 10X genoomijärjestuse katvus Coprinus cinereus, tüvi Okayama 7 (#130) jaoks. Coprinuse genoomiprojekt on Broad Institute'i ja Coprinuse teadusringkondade vaheline partnerlus.
Genoomne DNA genoomiprojekti jaoks andis Patricia Pukkila Põhja-Carolina Ülikoolist. Broad tootis kogu genoomi shotgun-järjestuse 4kb-st & 10kb plasmiidid ja 40kb fosmiidid. Saadud 10X koost tehti avalikuks juulis 2003. See Whole Genome Shotgun projekt on talletatud DDBJ/EMBL/GenBankis projekti AACS00000000 all. Automaatse genoomi annotatsiooni tulemused avalikustatakse 2003. aasta sügisel avaldatavates väljaannetes.
Coprinus cinereus on mitmerakuline basidiomütsiit, millel on tüüpiline seenekuju, mis läbib täieliku sugutsükli. Erinevalt enamikust seentest on C. cinereus suudab kogu oma elutsükli (2 nädalat) laboris lõpule viia. Selle lihtne kasvatamine lihtsal määratletud söötmel võimaldab ulatuslikku geneetilist ja molekulaaranalüüsi. Iga paaritumistüübi eosed toodavad monokarüootilist mütseeli. Ühilduvate hüüfide ühinemisel tekib dikariootiline mütsel, mis moodustab viljakeha - miniatuurseene, millel on kolm erinevat kude (kidur, vars ja müts).
Primordium kasvab ja hüümne kihtide basidiaalrakkude küülikutes algatab ja lõpetab tuumafusiooni, meioosi ja haploidse basidiospooride moodustamise. Spooride küpsemisega ja mütsist aktiivse väljutamisega kaasneb varre pikenemine ja allesjäänud küülikukoe autodigestioon.
Allikad:
Foto 1 - Autor: Aasapilk (CC BY-SA 4.0 International)
Foto 2 - autor: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Generic)
Foto 3 - Autor: M: James Lindsey (CC BY-SA 2.5 Üldine)
Foto 4 - Autor: M: Aasapuu (CC BY-SA 4.0 rahvusvaheline)
